Olá Carlos,
Tive as mesmas dificuldades na conversão do ficheiro .xml para .txt ou .srt, como indica na discussão do overstream.
A solução possível (mas longe da ideal) talvez seja mesmo a edição manual (copy/paste) da legendas.
Alguém está interessado a ajudar o Carlos nesta tarefa? Sendo recursos úteis para professores de Ciências Físico-químicas, a colaboração seria interessante.